| 安装加温滤水设备
最好能在水族箱的两端加装自动控制加热组件。(分离式的加热器也一样适用，但在许多国家的供电法规中，可能被禁用。)确定这项组件是垂直地安装，并须了解它的设计是全部或只是部分地沉在水中。此外，确定加热器安放在石粒外————过长的组件可以斜放在后箱板近处———千万牢记在各种装备上都要用塑胶夹子固定住。确实依照制造厂商提供的指导手册连接管线，并将之整齐地固定在管线排束之上。用塑胶制的空心管套住所有连接在外层温度自动调节器的金属弹簧夹，最后才接上温度计；在放满水之前不要用飘浮式温度计，但可在任何时间将液晶显示工的温度计黏在箱壁外。
将打气马达打出的空气经由打气石释放到水族箱中，理想的方式是把马达安装在槽内水面上的边壁，以防止箱内水流倒灌而造成电源之损坏，或因其他缘故致使打气马达停止运作。另有一法，即在空气管线上安装一个“单向的”调节阀，也要发挥同样的功效，而使用者可以视自己需要把马达安置在任何地方。
利用水族箱背后以砂石或珊瑚做为掩蔽之处放置一个长形的打气石，把打气石的空气管线连接在打气马达的其中一个空气活门上，并将管线埋在石粒之下。因为这些打气石需要常常更换，所以最好将它放置在易于接近的地方。把滤材装在滤水器的本体中，外部过滤器或紫外线杀菌灯可以装在水族箱的下方或吊持在后壁上，为了让各种管线都能从条内拉出来，可以在顶盖开一个小口，利用一根分散管将流回水族箱的水流分散开来，以避免大股的水流冲激在水族箱中的装饰品上，同时可挥散二氧化碳，以增加水质的清新。
如果不显得太唐突，可以把蛋白质分离器装在水族箱内，玻璃盖要有一截开的部分，以便替换蛋白质分离器上的集物杯，如果使用是臭氧机，须使臭氧直接输送到蛋白质分离器上，千万别将臭氧输送到生物过滤器的扬气管上，并须像空气马达一样，别让水族箱的水倒灌至臭氧机中。
将电源供应管线连接到外部电动过滤器、加温器、紫外线杀菌灯及臭氧机上。紫外线杀菌灯和臭氧机并非立刻就要使用，故可暂时不连接。
依水流流经过滤器的方向，把外部电动过滤器(反向水流使用)或过滤器的马达头(下向水流)接在生物过滤器的扬升管上。最后，加入所需要的珊瑚或石粒，利用这些饰物掩盖水族箱中的所有硬体设备，但须注意不能阻碍了水流，且谨记过多的装饰会减少鱼类活动的空间，更可能会阻挡了养殖者的视线，以致无法发现被困住的鱼只。
加强照明设备
水族箱的灯光设备至少具有下列几项功能：可作为水族箱之照明设备，是植物行光合作用的触媒剂，是细菌行分解作用的催化剂、是动物行代谢作用的能量来源，也是水族箱的热源之一等。因此水族箱的灯光就是水族箱的生命泉源，不仅关联到整个生态的平衡，更是关系到海水鱼及其他无脊椎动物是否能展露出自然原色，因此安装时一定要选择专为水族箱照明所制造的灯具，虽然价钱稍高，但却是不可或缺，且是水族能建立成功与否的关键。
使用防水设备并在顶盖上加装照明灯光，但须小心不要影响到顶盖而摔到玻璃罩上。
连接在萤光灯的启动器很重，可能会影响顶画受力的平衡，尤其是同时使用数根灯管时，最好将启动器装在另外的地方。
确保顶盖的通风良好，使灯光的热气可以全然挥散至水族箱外，并能排除水族箱内产生的二氧化碳。紧密的玻璃封盖除了可减少水分因蒸发而流失，还可防止鱼只跃出。也可以顶部不加盖的开放式水族箱的上方30厘米处架设吊灯，但须平均分散吊灯的投射光线，以免都只照射在水族箱中的某一局部。
此外，也须将灯光的插头连接到管线束排上。
准备养殖用水
现在将面临到如何调配人工海水的问题。很显然的，如果是初次使用的新水族箱，在装好装饰品及硬体设备之后，调配用水是相当容易的。
轻轻地将清水洲入水族箱里，才不会将各种装饰品及底层铺设冲坏。最好的办法是在箱中暂置一块大平板或是利用锅盖，使水间接流入，较不会造成大力的冲击。持续放水到满，再加一些盐，盐的分量最好控制在比预估的少一些，因为一点一点地加入以到达预期的含盐度总比盐加太多了，再以清水稀释要来得好。(注意，在水中加盐是比其他方法好得多了。)
如果要利用另外的容器先调配海水再注入水族箱中，则计算水量是个问题。最好的办法当然是直接使用天然海水，但在运送过程中不免会造成浪费。记得运送时不可使用金属容器。(请记得在每次定期部分换水时，你也需依此方法准备)
不论使用何种配制海水的方式，在最初测试所得的海水比重皆不是正确数值，只能等待温度到了一定的标准，且过滤系统开始运作而盐分已充分调匀后才能测出正确稳定的数值。
启动装置
此时开始在外部过滤器和紫外线杀菌灯的管路中注满水，这是一个简单的步骤，只要将连接水族箱的回水管打开即可吸入水，水注满各系统后，再把回水管接上，确定每根管子都已接好。
从管线束排上取出一条供电缆线接到一适合的管状插头上，将插头插上电源。
调整每个空气活门上的气流以便启动生物过滤器及打气石，水会从接在扬升管上的动力头流过来。检查从外部过滤器流出的水量是否充足。如果系统上有空气闭锁键，可轻轻摇动过滤器使滞留的空气排出。
由温度上的读数可看出加温装置是否正常运作。当温度上升到预先设定的读数时————约为24℃，便可用比得计测量水的比重了。(比重计可采耐用的胶质摇针型，这很方便使用，但须轻轻敲动使中间的气泡消散，以免读数有误。)如果比得过低，则需再加人工海盐，等水循环一阵子后再量，持续测量至比重达到标准；反之，则抽掉一些海水，再补充一些淡水使之降低。如果必要，重复这些步骤，使水的比重符合一定的标准。
培养生物过滤床
水族箱安装妥善后，须花一段时光培养硝化细菌。细菌稳定地增加且发挥功效时，氨及亚硝酸盐便会逐渐地减少。过滤床的成熟需要一段很长的时间————至少两个星期甚至一个多月————视依什么滤材繁殖而定。另外，有一些加速成熟的方法，但所有加速方法都是定量的供以氮肥化合物，以充当此系统的“能量”。
培养硝化细菌时，可以放入一些状况良好的水族箱旧砂，或添加已培养好的硝化细菌原液。亦可放入一些食物碎屑使之腐烂或放入一两条健壮的鱼使之供应需要的有机体废料。当然，选择几项方法并用亦为一途。
以测试剂测量氨和亚硝酸盐比例可以了解硝化细菌成熟的程度。开始的几天，亚硝酸盐的读数会增加，但到了最大直后，它的读数便会降回一个极小值，最好到0或小于0·１mg／L。此时，增加一些鱼类是很安全的，但不可放养到足量，无论如何，生物过滤器尚无法处理大量鱼只产生的氨及亚硝酸盐，唯有渐渐地增加鱼数才能使过滤器的功能慢慢地发挥。 | 
